MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Geobacter metallireducens GS-15 plasmid unnamed

Total Repeats: 60

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007515	GGC	2	6	1	6	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_007515	TGG	2	6	68	73	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007515	C	7	7	99	105	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4	NC_007515	T	8	8	106	113	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007515	A	6	6	152	157	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007515	CGG	2	6	168	173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_007515	AG	3	6	205	210	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007515	CT	3	6	410	415	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_007515	ATT	2	6	420	425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007515	TCTGCC	2	12	439	450	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
11	NC_007515	GCCGTC	2	12	523	534	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
12	NC_007515	GAA	2	6	544	549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007515	G	6	6	605	610	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007515	G	6	6	645	650	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007515	GAGG	2	8	721	728	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007515	G	6	6	733	738	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007515	CTA	2	6	783	788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_007515	A	6	6	799	804	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007515	GGT	2	6	862	867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007515	TCAC	2	8	916	923	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_007515	TCA	2	6	2230	2235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_007515	CGG	2	6	2291	2296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_007515	CTC	2	6	2349	2354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_007515	CACT	2	8	2376	2383	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_007515	CCT	2	6	3569	3574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_007515	GGA	2	6	3581	3586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007515	A	6	6	3615	3620	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007515	CAA	2	6	3650	3655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_007515	AGT	2	6	3687	3692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007515	AAG	2	6	3743	3748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007515	ATC	2	6	4509	4514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_007515	A	6	6	4528	4533	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007515	G	6	6	4538	4543	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007515	TCT	2	6	4568	4573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_007515	TCC	2	6	5270	5275	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_007515	CCT	2	6	6205	6210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_007515	CCGG	2	8	6229	6236	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_007515	TCC	2	6	6964	6969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_007515	C	6	6	6974	6979	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
40	NC_007515	CTTT	2	8	8503	8510	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_007515	TCT	2	6	11351	11356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_007515	TTA	2	6	11364	11369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007515	TTC	2	6	11415	11420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_007515	CCG	2	6	11427	11432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_007515	AT	3	6	11457	11462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007515	ATG	2	6	11513	11518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007515	AAC	2	6	11610	11615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_007515	GGCG	2	8	12262	12269	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
49	NC_007515	ATGA	2	8	12981	12988	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007515	CGG	2	6	13005	13010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_007515	AGGA	2	8	13071	13078	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007515	CTTTT	2	10	13398	13407	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_007515	C	6	6	13474	13479	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
54	NC_007515	CAA	2	6	13483	13488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_007515	CAGA	2	8	13523	13530	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_007515	AGTA	2	8	13533	13540	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007515	CTT	2	6	13587	13592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_007515	CGTGG	2	10	13593	13602	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
59	NC_007515	GAT	2	6	13623	13628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007515	TCT	2	6	13723	13728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.